Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms