Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf2P58021 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms