Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp25P57080 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp25P57080 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp25P57080 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp25P57080 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp25P57080 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp25P57080 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms