Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp5eP56382 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms