Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms