Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Dbx1P52950 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Dbx1P52950 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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Dbx1P52950 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Dbx1P52950 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Dbx1P52950 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Dbx1P52950 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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Dbx1P52950 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dbx1P52950 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms