Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp1P52624 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp1P52624 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp1P52624 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp1P52624 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp1P52624 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp1P52624 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp1P52624 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms