Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.3 ms