Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxc13P50207 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms