Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cox8bP48772 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cox8bP48772 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cox8bP48772 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cox8bP48772 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cox8bP48772 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cox8bP48772 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cox8bP48772 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms