Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms