Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl5P47962 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl5P47962 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl5P47962 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl5P47962 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl5P47962 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl5P47962 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl5P47962 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl5P47962 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl5P47962 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl5P47962 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rpl5P47962 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl5P47962 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl5P47962 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl5P47962 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl5P47962 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl5P47962 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl5P47962 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl5P47962 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl5P47962 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl5P47962 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl5P47962 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl5P47962 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl5P47962 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl5P47962 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl5P47962 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rpl5P47962 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl5P47962 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl5P47962 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl5P47962 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms