Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrprbP47758 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrprbP47758 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrprbP47758 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrprbP47758 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SrprbP47758 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrprbP47758 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms