Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax9P47242 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax9P47242 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax9P47242 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax9P47242 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax9P47242 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax9P47242 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax9P47242 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax9P47242 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax9P47242 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax9P47242 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax9P47242 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax9P47242 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax9P47242 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax9P47242 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax9P47242 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax9P47242 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax9P47242 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax9P47242 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax9P47242 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax9P47242 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax9P47242 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax9P47242 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax9P47242 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax9P47242 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax9P47242 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax9P47242 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax9P47242 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms