Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax7P47239 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax7P47239 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax7P47239 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax7P47239 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax7P47239 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax7P47239 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax7P47239 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax7P47239 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax7P47239 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax7P47239 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms