Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic1P46684 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic1P46684 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic1P46684 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic1P46684 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic1P46684 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms