Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ItgavP43406 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgavP43406 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgavP43406 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ItgavP43406 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ItgavP43406 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ItgavP43406 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms