Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Mmp9P41245 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Mmp9P41245 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Mmp9P41245 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp9P41245 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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