Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpargP37238 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpargP37238 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpargP37238 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpargP37238 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PpargP37238 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpargP37238 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpargP37238 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpargP37238 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpargP37238 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpargP37238 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpargP37238 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpargP37238 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpargP37238 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpargP37238 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpargP37238 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpargP37238 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpargP37238 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpargP37238 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpargP37238 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpargP37238 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpargP37238 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpargP37238 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpargP37238 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpargP37238 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpargP37238 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpargP37238 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpargP37238 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PpargP37238 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpargP37238 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpargP37238 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpargP37238 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpargP37238 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpargP37238 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpargP37238 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PpargP37238 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PpargP37238 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PpargP37238 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PpargP37238 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PpargP37238 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PpargP37238 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PpargP37238 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpargP37238 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpargP37238 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpargP37238 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpargP37238 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpargP37238 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpargP37238 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpargP37238 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpargP37238 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpargP37238 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpargP37238 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpargP37238 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpargP37238 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PpargP37238 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpargP37238 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpargP37238 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpargP37238 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpargP37238 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpargP37238 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpargP37238 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpargP37238 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpargP37238 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpargP37238 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpargP37238 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpargP37238 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpargP37238 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpargP37238 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms