Protein–RNA interactions for Protein: P32848

Pvalb, Parvalbumin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PvalbP32848 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PvalbP32848 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PvalbP32848 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PvalbP32848 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PvalbP32848 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PvalbP32848 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PvalbP32848 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PvalbP32848 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms