Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms