Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Etv4P28322 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Etv4P28322 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Etv4P28322 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Etv4P28322 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Etv4P28322 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Etv4P28322 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Etv4P28322 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Etv4P28322 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Etv4P28322 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Etv4P28322 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Etv4P28322 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Etv4P28322 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Etv4P28322 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Etv4P28322 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Etv4P28322 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Etv4P28322 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Etv4P28322 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Etv4P28322 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Etv4P28322 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Etv4P28322 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Etv4P28322 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Etv4P28322 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Etv4P28322 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Etv4P28322 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Etv4P28322 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Etv4P28322 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Etv4P28322 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Etv4P28322 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Etv4P28322 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Etv4P28322 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Etv4P28322 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Etv4P28322 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Etv4P28322 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Etv4P28322 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Etv4P28322 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Etv4P28322 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Etv4P28322 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Etv4P28322 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Etv4P28322 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Etv4P28322 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Etv4P28322 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Etv4P28322 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Etv4P28322 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Etv4P28322 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Etv4P28322 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Etv4P28322 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Etv4P28322 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Etv4P28322 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Etv4P28322 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Etv4P28322 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Etv4P28322 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Etv4P28322 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Etv4P28322 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms