Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms