Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde6aP27664 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms