Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra3P26049 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms