Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gria1P23818 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gria1P23818 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gria1P23818 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria1P23818 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria1P23818 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria1P23818 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms