Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Olfr1224-ps1-201ENSMUST00000099792 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm12171-201ENSMUST00000150895 1257 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Hoxd11P23813 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Hoxd11P23813 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Hoxd11P23813 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms