Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd12P23812 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms