Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms