Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Hoxb1P17919 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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