Protein–RNA interactions for Protein: P15116

Cdh2, Cadherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh2P15116 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh2P15116 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh2P15116 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh2P15116 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh2P15116 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh2P15116 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh2P15116 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh2P15116 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh2P15116 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh2P15116 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdh2P15116 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh2P15116 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh2P15116 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh2P15116 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh2P15116 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh2P15116 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh2P15116 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh2P15116 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh2P15116 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh2P15116 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh2P15116 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh2P15116 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh2P15116 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh2P15116 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh2P15116 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh2P15116 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh2P15116 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh2P15116 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh2P15116 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh2P15116 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh2P15116 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh2P15116 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh2P15116 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh2P15116 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdh2P15116 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh2P15116 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh2P15116 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdh2P15116 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms