Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb1P12658 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb1P12658 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb1P12658 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb1P12658 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms