Protein–RNA interactions for Protein: P12400

Ctla2b, Protein CTLA-2-beta, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2bP12400 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctla2bP12400 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctla2bP12400 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctla2bP12400 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctla2bP12400 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctla2bP12400 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctla2bP12400 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctla2bP12400 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctla2bP12400 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctla2bP12400 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctla2bP12400 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctla2bP12400 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctla2bP12400 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctla2bP12400 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctla2bP12400 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctla2bP12400 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctla2bP12400 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctla2bP12400 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctla2bP12400 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctla2bP12400 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctla2bP12400 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctla2bP12400 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms