Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms