Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lire1P11260 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms