Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PolP10400 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PolP10400 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PolP10400 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PolP10400 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PolP10400 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PolP10400 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PolP10400 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PolP10400 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PolP10400 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PolP10400 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PolP10400 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PolP10400 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PolP10400 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PolP10400 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PolP10400 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PolP10400 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PolP10400 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PolP10400 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PolP10400 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PolP10400 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PolP10400 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PolP10400 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PolP10400 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PolP10400 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PolP10400 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PolP10400 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PolP10400 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PolP10400 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PolP10400 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PolP10400 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PolP10400 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PolP10400 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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