Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms