Protein–RNA interactions for Protein: P0C5K0

Sbk3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbk3P0C5K0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms