Protein–RNA interactions for Protein: P06332

Cd4, T-cell surface glycoprotein CD4, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd4P06332 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd4P06332 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd4P06332 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd4P06332 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd4P06332 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd4P06332 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd4P06332 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd4P06332 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd4P06332 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd4P06332 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd4P06332 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd4P06332 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms