Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P04212 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P04212 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P04212 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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