Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt1P04104 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt1P04104 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt1P04104 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt1P04104 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt1P04104 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt1P04104 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt1P04104 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt1P04104 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms