Protein–RNA interactions for Protein: O88892

Serf1, Small EDRK-rich factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serf1O88892 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Serf1O88892 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Serf1O88892 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Serf1O88892 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Serf1O88892 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Serf1O88892 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms