Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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ComtO88587 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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ComtO88587 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ComtO88587 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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ComtO88587 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ComtO88587 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ComtO88587 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ComtO88587 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ComtO88587 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ComtO88587 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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ComtO88587 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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ComtO88587 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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ComtO88587 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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ComtO88587 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ComtO88587 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ComtO88587 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ComtO88587 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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ComtO88587 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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ComtO88587 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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ComtO88587 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ComtO88587 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ComtO88587 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ComtO88587 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ComtO88587 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ComtO88587 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ComtO88587 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ComtO88587 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ComtO88587 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ComtO88587 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ComtO88587 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ComtO88587 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ComtO88587 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ComtO88587 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ComtO88587 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ComtO88587 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ComtO88587 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ComtO88587 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ComtO88587 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ComtO88587 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ComtO88587 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ComtO88587 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ComtO88587 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ComtO88587 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ComtO88587 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ComtO88587 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ComtO88587 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ComtO88587 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms