Protein–RNA interactions for Protein: O88466

Znf106, Zinc finger protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 1,888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf106O88466 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf106O88466 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf106O88466 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf106O88466 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf106O88466 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf106O88466 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf106O88466 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf106O88466 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf106O88466 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf106O88466 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf106O88466 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf106O88466 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf106O88466 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf106O88466 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf106O88466 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf106O88466 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf106O88466 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf106O88466 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf106O88466 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf106O88466 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf106O88466 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf106O88466 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf106O88466 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf106O88466 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf106O88466 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms