Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme6O88425 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme6O88425 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme6O88425 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms