Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms