Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma3O70435 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma3O70435 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma3O70435 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma3O70435 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma3O70435 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma3O70435 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma3O70435 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms