Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26a1O55127 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms