Protein–RNA interactions for Protein: O55112

Aff2, AF4/FMR2 family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff2O55112 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aff2O55112 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aff2O55112 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aff2O55112 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aff2O55112 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff2O55112 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff2O55112 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff2O55112 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff2O55112 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff2O55112 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms