Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syngr2O55101 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syngr2O55101 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syngr2O55101 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syngr2O55101 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syngr2O55101 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syngr2O55101 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syngr2O55101 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syngr2O55101 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms